نرم افزار منهاج با استفاده از تکنیک های یادگیری و اصول مطالعه طرحی نو از یادگیری مفاهیم قرآنی را به  صورت نرم افزاری بسیار شکیل ارائه کرده است. در این نرم افزار با استفاده از مرور و تکرار های اصولی مفاهیم کلمات قـرآن سعی شده تا مفاهیم قرآنی به حافظه بلند مدت فرد منتقل شود. نرم افزار منهاج  کاربر را در حین فراگیری مفاهیم کلمات قرآن به حفظ مفاهیم آیات نیز سوق داده که نتیجه آن آموزش کامل ترجمه و مفاهیم قرآن است. از آنجایی که درک مفاهیم قرآن گامی بلند در جهت حفظ آیات قرآن می باشد، بخشی برای این منظور در نظر گرفته شده است که کاربر می تواند با استفاده از امکانات ایجاد شده به حفظ آیات بپردازد.

ارائه بیست و دو جلسه آموزش قواعد به صورت تصویری توسط حجت الاسلام و المسلمین دکتر یعقوبی به همراه امکان مشاهده قواعد تجویدی به صورت هوشمند درکل قرآن یکی دیگر از امکانات این نرم افزار است، که از این مجموعه اثری جهت کامل کردن چرخه آموزش قرائت، حفظ و تدبر در قرآن ساخته است.

محتویات نرم افزار:
یازده دوره ترجمه: آیت الله مکـارم شیرازی، فولادوند، انصـاریان، الهـی قمشه ای، خرمدل،آیتی، خرمشـاهی، معزی، مجتبوی، صادقی تهرانی،  بهرام پور
چهار دوره تفسیر : المیزان، نــور، مجمع البیـان، راهنمــا
یک دوره تحقیق از خلیل الحصـری
سه دوره ترتیل: مشاری العفاسی، سعد الغامدی، عبدالباسط